Предыдущая еврейская община в Котбусе существовала до 1938 года. Она насчитывала в то время 397 членов. Это были врачи, адвокаты, юристы и ювелиры. Среди них были очень влиятельные люди города. Еврейская община Котбуса считалась одной из самых богатых общин Германии. В так называемую, печально известную «Хрустальную ночь», 9 ноября 1938 года синагога в Котбусе была сожжена. С этого события община прекратила своё существование. После уничтожения нацизма в живых оставалось всего 12 членов прежней общины.

15 июля 1998 года Еврейская община Котбуса была воссоздана вновь. Сейчас это зарегистрированное общественно-религиозное объединение.
В настоящее время община насчитывает около 350 галахических евреев. Все члены общины приехали из бывшего Советского Союза. Руководство общины поддерживает связь с 3 бывшими членами общины, которые впрочем не являются сейчас членами общины. Одна из причин, по которым эти люди не хотят становиться членами общины, это память о «Хрустальной ночи».